作为少年三国志系列的全新力作，少年三国志零在武将培养系统上进行了颠覆性创新。游戏取消了前作固定的主角设定，改为以8位主将为核心的多维度培养体系，同时引入军师系统和小兵系统，形成武将+军师+兵种的三位一体培养架构。这种架构要求玩家在资源分配上需要更精细的规划，特别是在主将选择、兵种搭配和军师技能协同方面需要综合考虑。
游戏中的武将培养包含升级、统兵、进阶、升星、技能及丹药六个维度。与系列前作相比，少年三国志零新增了统兵系统，主将的统兵等级决定了携带兵种的强度，而兵种又分为盾兵、步兵、轻骑、重骑、弓手和谋士六大类型，每种兵种都有明确的定位和克制关系。玩家需要通过太学系统提升统兵等级，解锁特殊兵种如西凉铁骑、飞雄军等高级单位，这使得培养过程更具策略深度。
军师系统是本作培养体系的重要创新点。军师拥有独立的计谋、法器和奇门三个培养方向，计谋为手动释放的战场技能，法器强化技能效果，奇门则提供全局属性加成。军师培养需要消耗专属资源如兵法心要，且不同军师适配不同阵容流派，如周瑜强化弓兵流，张宝专注召唤流，这种设计大幅提升了阵容搭配的多样性。军师与武将的培养资源并不冲突，这要求玩家需要合理分配两种培养路径的资源投入。
宝物系统在培养体系中扮演关键角色。宝物需要特定武将激活，提供三维属性、部队攻击生命和军师技能伤害加成。宝物获取主要通过剧本通关、天工开物锻造和宝物商店兑换，培养过程涉及品质提升和等级突破。与系列前作相比，本作的宝物系统更强调与武将的专属绑定关系，且红色宝物和红武魂的获取难度较高，这在一定程度上决定了后期阵容的强度上限。
游戏采用动态平衡的培养机制，通过图鉴系统将收集要素转化为实战加成。图鉴分为魏蜀吴群四大阵营和六大兵种两类，主将只能激活其中一种图鉴。图鉴评分与主将星级和品质挂钩，通过消耗军令可进行图鉴突破。这种设计既保留了卡牌游戏的收集乐趣，又将收集要素转化为可量化的战力提升，使得培养过程更具目标性和持续性。
少年三国志零通过多维度的培养系统，构建了更具策略深度的成长体系。游戏在保留系列经典元素的基础上，通过军师、兵种、宝物等系统的创新融合，形成了独特的复合型培养架构。这种设计既满足了核心玩家对策略深度的追求，又通过系统间的相互关联降低了单一系统的培养压力，展现出系列作品在玩法创新上的探索方向。
