元气骑士新增了多组武器合成公式，其中最具代表性的是光剑土豪金与躁动树干的组合。光剑土豪金需通过设计台研发获得，消耗蓝图及2000钻石，而躁动树干可通过击败BOSS圣诞树人或商人购买获取。该组合的核心机制在于骑士职业的全力攻击技能可同时激活两把武器效果，光剑土豪金负责抵挡子弹，躁动树干提供移动速度加成与持续伤害，形成攻防一体的战斗模式。由于光剑无蓝耗且树干能耗极低，该组合在实战中具有极高的续航能力。
暑期版本推出的武器合成系统新增了三把武器合成的机制，例如嘤嘤鹰需要两把不同鹰类武器加樱花霰弹枪合成。鹰类武器包括沙鹰、外星之鹰、冰霜之鹰等，但雪人之鹰不可参与合成。雪狐系列武器可通过雪狐L叠加合成至XXL形态，雪狐土豪金与樱花霰弹枪结合可生成雪狐玫瑰金。时代冲锋枪系列则通过欠欠前缀武器逐级合成，最终形成次次次次时代冲锋枪，这种递进式合成体系显著提升了武器的基础属性。
近战武器方面，三色光剑（红、蓝、绿）相加可合成光剑土豪金，其特殊之处在于蓄力后能产生扇形扫射效果。雷剑作为另一把合成武器，由火焰剑与冰霜剑组合而成，具备挥砍放电的特性。群星之弓需要珺之弓、火焰弓和冰霜弓三把武器合成，射击时会伴随陨石坠落效果。这些合成武器普遍存在共同限制：合成必须在地牢中进行，骑士之家无法完成操作，且带有配件的武器需先卸除配件才能融合。
特殊合成机制中，喷漆配件与基础武器结合能产生质变。通过配件商人或兑换券获取的黄金喷漆，可将普通法杖升级为黄金法杖，沙鹰转化为黄金沙鹰。蓝色喷漆与加特林组合生成蓝火加特林，与织网者结合则形成剧毒织网者。食品类武器配合便携式烤炉配件可转化为恢复型道具，如萝卜烤制后恢复2点生命值。这些合成路径虽然不直接提升战斗强度，但拓展了武器的功能性应用场景。
当前版本最受关注的远程组合是强化突击步枪系列，基础突击步枪通过两次合成可升级为强化突击步枪+，再与激光武器（审判者、碎冰者等）融合生成突击步枪-战术精英版，其属性由所用激光武器决定。榴弹机枪则需强化突击步枪与火箭炮合成，兼具范围伤害与持续输出能力。量子手里剑由两把电弧手里剑合成，风魔手里剑叠加后形成风之手里剑，这类投掷武器在清图效率方面表现突出。
机械狂潮赛季新增的芯片系统为武器升级提供了新维度，击败燃料房BOSS概率掉落芯片，赛季商店也可用赛季币购买补给箱获取。芯片精炼等级最高可达10级，直接影响武器性能提升幅度。部分合成武器如超级大宝贝需要蓝图解锁，其全图500点伤害爆破效果虽强，但会伴随持续毒雾，需搭配毒抗属性使用。玩家在搭配武器组合时，需综合考虑版本特性、合成成本与实战需求，才能发挥最大战斗效能。
